导演继续走哲思路线，晴生放弃成为怪物也就失去了向哥斯拉复仇的机会，三种人类在知道晴生作战失败后各有打算。哥斯拉是人类文明造就的怪物，而另一文明则造出了基多拉，基多拉消灭哥斯拉则人类灭亡，阻止基多拉则失去了当时唯一杀死哥斯拉的机会。文明的贪婪造就了怪物，当晴生问地球的原始人哥斯拉可怕么，她们的回答是打雷可怕，地震可怕，哥斯拉可怕。晴生明白哥斯拉之所以是怪物是源于人类要胜过万物的贪欲，最后亲手将人类向哥斯拉复仇的武器(他和武器)终结。

电影某种程度上可算作是哥斯拉系列的终章。将此片与第二弹比较，在影片的立意上，又提升了一个高度，晴生在面对消灭哥斯拉的唯一机会选择放弃，被梅特菲斯利用，成为了宣扬宗教布道的工具，而异次元怪兽基多拉的引入，则带来了消灭哥斯拉的同时自我毁灭的选择悖论。影片有价值之处在于，虽然没有看过第一部哥斯拉毁灭地球的前传，但导演在终章中，通过晴生与操控基多拉的梅特菲斯的异次元时空对话，以回忆的视角解析了两个人物所代表的不同世界观，由于人类的欲望，造成了哥斯拉的悲剧，而通过祈求神迹消灭哥斯拉的同时摧毁整个文明的方式来消灭贪婪，让电影的隐喻进一步提升，最后在地球重回希望后，“晴生”也以殉道的方式实现自我超脱。

无敌的基多拉又双叒叕要输了