幕府时代，身负隐秘的户田秋谷 （ 役所广司 饰）因七年前与藩主侧室私通的罪名，被赐切腹但缓刑十年，期间受命撰写藩主家谱。“蜩之记”即秋谷日记的题名，夏蝉入秋，自知余命不多，却能不计生死，笃定而行。在藩主城内因持刃伤人犯下重罪的檀野庄三郎 （ 冈田准一 饰），被遣罚乡下监督还有三年期限的秋谷。在与秋谷一家的共处中，庄三郎逐渐被秋谷的正直人格所打动，并生出惺惺相惜的师徒情感。庄三郎发现了秋谷的冤情，而冤情背后还有着左右藩国命运的更大迷局 。