本作讲述的是在现实世界，有个名为新星勉的小学生，他是个奥迷。一天晚上他在观看《盖亚·奥特曼》的录像时被卷入奇怪空间，看见一个红色的球，以及一个站在火海中的女孩。第二天在学校，这个女孩竟真的出现，她就是勉的新同学——沉默寡言的七濑理沙。就在同一天，勉真地发现自家的仓库中就放着那个红色的球。 红球自称可以帮人实现任何愿望。勉在理沙的鼓动下，向球许愿希望见到电视中的角色高山我梦。红球发出光芒，随后天空出现怪异 云团，从云团中飞出了驾驶着Fighter EX的我梦。勉兴奋地追过去，并告诉其他人关于这个球的事。包括平时在学校恃强凌弱的校霸鹿岛田浩、小杉亘、中原耕平 三人组也知道了。浩把球抢在手中，声称要召唤出一只怪兽，不料精神寄生兽-撒旦比佐立刻出现了，吓得浩一下丢下了球。我梦见情况不妙，立刻变身为盖亚·奥特曼对付怪兽。勉捡回了球，连同好友平间优和理沙观战。然而盖亚刚出现不久就能量不足了，陷入了苦战，幸而最终还是很快战胜了怪兽。盖亚变回 人间体我梦，返回EX，但此时的EX已被一大群小朋友围得水泄不通，大家异口同声叫我梦“变身”。我梦为逃脱孩子们的追踪，躲进一家 奥特曼玩具店，看到玩具店里到处都是奥特曼系列的人偶、变身器等，以及电视上正在播出的《盖亚奥特曼》剧集，又被店主认出自己的真实身份，我梦才知道自己穿越了时空。勉找到了我梦，告诉他事情的缘由，并让我梦遥控EX开进自家的仓库。我梦用 分析仪采集了红球的数据。勉希望我梦能给他的图书《 格列佛游记》签名，但我梦还未来得及签名就听到了仓库外的喊声，便顺手把书放在分析仪上。而浩、亘、耕平三人此时企图再次夺走红球，用它的力量创造出一只更加强大的怪兽。此时，警方已经把仓库包围，意图逮捕“国籍不明的空军飞行员”我梦，勉极力请求停止。就在混乱中，红球脱手并滚到街上，被浩等人再次拿到；我梦、EX也莫名其妙地消失了。回到自己的世界的我梦，偶然回忆起穿越时空的事，并看到了和自己一同穿越过来的那本勉的《 格列佛游记》，意识到自己真的穿越了时空，于是察看了保存在分析仪中的红球的数据，得知红球是另一个次元的人类以最 顶尖科技制造出来的超时空机器，那些人类为了满足自己的欲望而制造了它，而它也是以人的欲望来获取能量的。但由于人的欲望是没有止境的，最后那些人被自己的贪婪所毁灭了。而红球就不断穿越到一个个 平行世界中，继续为他人满足欲望，然后那个世界就会重蹈覆辙，以及理沙站在那毁灭的世界中的情景。我梦意识到勉的世界亦将面临同样毁灭的命运。与此同时，勉等人到处寻找，终于在学校美术室找到了浩等人，他们正在制作自己想要的怪兽模型。勉、优想偷偷地拿回红球，但被浩、亘、耕平三人发现，红球通过吸收浩、亘、耕平三人的恶念已经变得非常强大且邪恶，它控制了浩、亘、耕平。被控制的三人押着勉、优走上天台。浩利用红球把模型怪兽欧布猛斯王实体化了。