位于大阪的鸨屋蛟龙堂最初以药材批发业务起家，之后依靠秘方配制的药丸逐渐声名远扬。到了第二代，两名弟子彼此不服气，致使蛟龙堂分裂，两家店铺在街道对门经营，分别以“元祖”和“本家”自称，暗中争斗多年。两年前，本家第三代当家善池喜一郎与元祖当家丸部长彦发生冲突，喜一郎用硫酸将长彦毁容。这一悲剧发生后，长彦戴着面具深居阁楼，喜一郎则下落不明。某日，喜一郎的妹妹初惠邀请青年侦探金田一耕助调查本家员工被跟踪一事，金田一却亲眼目睹长彦遭绑架并遇害的惊人场景。延续了两代的纷争仍在持续，金田一不得不努力解开隐藏多年的谜团，而已功成名就的名侦探明智小五郎则化身为记者，与金田一展开一场侦探之间的较量…… 本片根据芦边拓的原作改编。