东京都八王子市的警察署独身寮发生了定时炸弹爆炸事件，造成了大量人员死亡。警方断定这是激进派团体所为，警视厅公安部的池部警视（根津甚八）被指定负责统筹此次调查。 八潮警察署的岩田警部（タモリ）和田仓警部补（江口洋介）等知名搭档刑警，原本负责调查京浜运河的他杀尸体案件。随着调查的深入，媒体和大众开始关注爆炸案与杀人案之间的关联。于是，警视厅公安部和八潮警察署联合成立了调查总部。岩田警部和田仓警部补在调查尸体身份的过程中，意外发现这两起案件似乎与大约17年前的一起爆炸恐怖袭击事件有关。