《幻影神奇宝贝的主谋》于2006年4月29日首次在Kids' WB电视台上映，之后又于2006年10月31日在东京电视台播出。该片是为庆祝神奇宝贝10周年而制作，由美国华纳兄弟电影公司（Warner Bros.）制作发行，目前有英语和日语两个版本。