天正9年、忍びの集団・伊賀の国は織田信長と甲賀の大軍に攻め入られ、苦戦を強いられていた。敵は伊賀に密偵を放つが、伊賀の上忍が内部に潜む裏切り者たちの密会を突き止め、凄腕の下忍・突破を敵の元へ送り込む。自爆攻撃を命じられた突破は腹に爆薬を巻き、護衛の下忍・三者らと敵が潜む洞窟へと向かうのだが……。