七星侠离开地球五年，期间来自外太空的入侵暂时停止，宇宙警备队的军力也大幅削减。主角风森离开宇宙警备队，世界看似恢复了和平。之后，宇宙警备队新成员由纪和奈美在追查磁力异常反应事件时，发现了黑暗空间。宇宙警备队受命对其展开清剿，而这些巴格沙星人的企图究竟是什么……