《疯狂的外星人》这部电影的主要内容讲述了一个号称银河系最先进的外星文明试图和地球建交。C国代表全人类和这个外星文明进行建交，在建交仪式进行时需要双方交换各自的基因。在双方交换各自基因的过程中产生了一些误会导致发生了意外，外星使者的飞船坠入大气层，最终摔在了中国某市的世界公园中。靠耍猴戏为生的耿浩和酒贩子好友大飞把这个意外坠落受伤的外星人错认为是来自南美洲的猴子，并取名为刚果骚骚猴。因为自家猴子欢欢受伤了暂时无法表演，耿浩就开始训练起刚果骚骚猴以代替自家猴子欢欢来表演。由于外星人失去了超能力加成设备，外星人的超能力无法发挥，只能忍气吞声，一边先忍受着这两个地球人的严苛训练，一边试图寻找机会夺回自己的超能力设备能量环。而另一方面，之前与外星人交流失败的C国根据外星人留下的信息，穿梭世界各地寻找外星使者。于是他们在这个过程中发生了一些令人啼笑皆非的故事。