• 导演黄岳泰此前曾是《十月围城》的摄影指导，并屡获香港金像奖最佳摄影奖。对于此次转型担纲导演。他调侃道：“原因很单纯，为了满足一个心愿，在六十岁之前，拿下新晋导演奖。”
• 开机当天本片的女一号秦岚因身在巴黎，无法参加开机仪式，但她在开机前夕专程致电，为《别有动机》剧组送上了大洋彼岸的祝福。据透露，秦岚此次的角色将深陷罪案与情感的纠葛之中。
• 电影中有百分之八十的戏份都是下雨时拍的。演员每一个镜头都淋着雨拍摄，非常辛苦，而且经常没有时间换装，只能穿着湿衣服进行拍摄。
• 高圣远在家中就中文台词询问周迅意见来帮助自己纠正一些中文发音与语气。
• 片中有大量推理悬疑的因素，为了表现影片扑朔迷离的特质，导演透露：“这个戏中，不是烟雾，就是下雨，不管白天、晚上，甚至到轮渡上，我也安排了下雨的场景。烟、雾、雨的设置大大提升了画面里营造的气氛，将戏里面的紧迫、压抑、偷窥、监视、跟踪表现的更为极致。“
• 黄岳泰导演因为道具的摆放位置与之前的设置出现了一些偏差，而严肃地要求重新摆放到位。导演称：涉及到20年前与20年后的线索，虽然很细小，但是很重要，一定不能出现丝毫差错。”
• 秦岚饰演女一号叶霜，是一个极其虐心的角色，片中有大量哭戏。每天都哭到眼睛红肿，甚至有一场戏连续拍了十几个小时，秦岚也连着哭十几个小时。
• 这是高圣远在中国拍摄的首部动作电影。
• 片中有一场废旧仓库驾车逃脱的戏，刘威不仅要飞速飙车撞击铁门，同时还需穿越狭窄地带追击和漂移，甚至要制造出与并行车辆撞击的惊险画面。为此，拍摄现场布置了近100米的灯林，并利用11台摄影机从不同的角度捕捉飙车场面，刘威不论是在敏捷度还是体力上都完美的呈现这一场面。
• 动作指导罗礼贤是香港电影特技领域大名鼎鼎的人物，曾为《碟中谍3》、《木乃伊3》等多部大片担纲特技指导，更曾凭借电影《飞虎》、《B计划》拿到金马奖与金像奖“最佳动作指导”提名。
• 有一场晚上的雨戏，秦岚当时已经被浇了五六个小时了，人都已冻透了，一直在那打冷战。任达华担心她感冒送了药和暖宝宝，真的像一个父亲一样的关心秦岚。
• 林家栋其实一开始对于电影邀约是拒绝的，因为他之前拍摄过很多相似类型的影片，但最后打动他的是电影中的“情”，这份情让他看到了这个角色与众不同的一面，因此才决定接演。
• 片中的两次车祸并没有用效果合成，而是实实在的真车撞击。
• 导演黄岳泰透露，因为影片剧本非常复杂剧情逻辑十分烧脑，曾有不少公司因为看不懂而放弃投资拍摄，连老演员任达华都曾三次向导演表示看不懂剧本。
• 黄岳泰是一位很关心人的导演，在拍摄期间屈菁菁生病，他会嘱咐工作人员为她煮姜汤缓解病情，并在身体好转的情况下再安排她的戏份。
• 在拍摄电影中一场重头戏时，为了给观众呈现出一场视觉盛宴，剧组所有人拼命赶工，抢在向日葵花期结束之前完成相关剧情拍摄。
• 在一场薰衣草花田的重头戏，高圣远为了真实而饱满地演绎人物，拒绝使用护膝，直接双膝跪倒在长满梗茎的花田里恸哭，额头的青筋都爆了出来。