• 上一次以大型船舰为舞台开展故事的是同系列第九部剧场版《水平线上的阴谋》，距今已有8个年头。
• 樱井武晴此次是首度为动画作品创作剧本，他为本片写了不同的剧情大纲，但“宙斯盾”这份是他认为最困难且没打算采用的一个，偏偏青山冈昌对此最感兴趣，遂大力倡议促成。
• 柯南的作者青山冈昌是“相棒系列”的粉丝，他曾在该系列2011年正月SP作品《圣战》中饰演一个角色，而《名侦探柯南》单行本第48卷中也曾对《相棒》的主角杉下右京作过介绍。
• 京都府的舞鹤，此前也是《迷宫的十字路（迷宮の十字路）》（2003）和《漆黑的追踪者（漆黒の追跡者）》（2009）两部剧场版的故事舞台。
• 齐藤和义是除B’z之外，首个为柯南系列剧场版演唱主题歌的男性歌手，这首主题歌《One More Time》也是齐藤出道20周年纪念企划的第一个作品。
• 按照惯例，与剧场版相关的小故事通常回收录到OVA作品中，不过本次的小故事被首次放在电视台中播出，播出时间为剧场版公映的前一天，编剧也由樱井武晴担任。
• 柴崎幸称最喜欢的角色是灰原哀和怪盗基德。
• 女王录音结束后曾认真听了一遍，发现自己的声音偏小，“输给其他声音了”，因此曾请求导演重新录音。
• 制作方配套发行了在影片中出现的一款手表，售价2.45万日元。
• 青山冈昌也参与了藤井七海的人设工作，并在听说该角色由女王来客串时，针对柴咲幸的气质在眉毛等处做了特别的考量和设计。
• 在青山老师的创作规则中，其中有一条就是“柯南不能哭”，此番似乎该规则有被打破的可能。
• 日本现役自卫队队员中，仅有4%是女性。
• 2013年4月9日，柴咲幸随剧组拜访神奈川海上自卫队横须贺总监部，并登上了护卫舰“梅雨”，与约30名女自卫队员行军礼，共同祈愿影片大卖。
• 制作方同时公布了《鲁邦三世 VS 名侦探柯南（ルパン三世VS名探偵コナン THE MOVIE）》电影版的制作计划，预计于2013年12月上映，柯南迷将有望在一年之中看到两部柯南电影。上一次这两位“名侦探”的共演是在2009年日本电视台55周年暨读卖电视台50周年联袂推出的SP中。
• 本次在片头部分就出现了惯例的“冷谜语”，是继M 5《通往天国的倒计时》后的第二次。
• 由于案件不属于警视厅管辖范围，所以原来每次都直接参与调查的目暮警官等角色本次只作为毛利小五郎的协助调查者出场。前16部剧场版中均登场的白鸟任三郎本次只在片头介绍中有露脸，没有正式登场。
• 正式海报和场刊宣传册上有宙斯盾舰发射导弹的情景，正片中并没有出现。
• 第15部剧场版《沉默的15分钟》后退居“总导演”一职的山本泰一郎本次正式退出导演工作（但以监修身份参与制作），本作成为静野孔文首次独立导演的作品。本作脚本（编剧）为日本著名推理剧作脚本师樱井武晴，代表作有日本热门长寿推理剧系列《相棒》《科搜研之女》等。推理元素有很大增强。宣传中也打出了“柯南史上空前的间谍推理”字样。