• 影片将在日本冲绳岛的水底开拍。黄百鸣说：“这次是一个很大胆挑战，我们请的是有潜水经验的摄影师，包括灯光师，导演、演员的其他剧组成员也都要到水底去工作。在拍摄前，没有经验的工作人员特别是演员要训练适应水底的工作环境。这个是个蛮大的工程，所以之前的准备工作要做得很充足。”
• 影片中的故事是发生在日本与那国的一座真实存在的、沉睡海底万年的古城之中。徐克在拍摄《深海寻人》时决定以全程实景拍摄的手法，将这个充满挑战性的海底都市作故事背景，拍摄一部集合悬疑、惊悚、浪漫于一身的电影。大部分日本人都不知道，这是首家电影公司，愿意花费巨资、人力和时间，认真制作一部以与那国岛遗迹为题材的电影作品。
• 起初的《深海寻人》叫《深海寻尸》，此后又动过《深海寻夫》的念头，但最终只以一‘人’字代替，既指大家都明白的男主人公国栋，同时暗示另有一‘尸’埋藏深海。
• 演员和工作人员都要在水下完成拍摄任务，危险程度自不必说，而且在水下不能用语言交流，一旦呼吸方式不正确，随时还有可能发生片中所描述的“氮醉”等危险事件。郭晓冬因为小时候曾溺水而对大海有心理阴影，尤其是到深海中，周围几十米都是水的地方，怕极了这种空间状况。但作为影片的男一号，郭晓冬必须学会潜水，后来在一次拍摄中还是遭遇危险，他演到一半时突然发现氧气面罩漏水，若不是处理及时，在深海之中恐怕要有意外。