这是根据サンライズ的WEBサイト「矢立文庫」连载小说改编，在智能手机应用「ガンダムファンクラブ」独占先行配信的全6话短片动画「機動戦士ガンダム Twilight AXIS」添加新作场景后的特别版。宇宙世纪0096年，即「シャアの反乱」发生三年后，地球联邦政府因感受到塞可缪框架（サイコフレーム）存在的威胁，命令情报部的メーメット・メルカ中尉组建特殊部队「マティスマ」，潜入并调查在地球圈漂浮的小行星阿克西斯（アクシズ）被分割后的一侧。加入了原吉恩（ジオン）技术人员アルレット・アルマージュ和ダントン・ハイレッグ这两名民间人士的「マティスマ」成员潜入阿克西斯后，遭遇了神秘新型高达的强袭。该特别版与「機動戦士ガンダム サンダーボルト BANDIT FLOWER」同时上映。