士官候补生千早群像及其同伴们机缘巧合登上了昔日大日本帝国海军的潜水艇“伊401”，由此展开一系列故事。男主角千早群像临时担任“伊401”的舰长，女主角伊欧娜是“伊401”的拟人化形象。