乱世之中，有传言称手持魔刀妖刀村正之人可治天下。围绕这把刀，丰臣军与德川军展开的激烈争夺不断升级。元和元年，在最终决战前夕，德川军陆续在大阪城周边集结，面对此景，丰臣军的士气日渐低落。此时，仍企图暗杀家康的丰臣方将领真田幸村，为再度鼓舞士气，命令部下忍者猿飞佐助去寻找那把传说中得之可握天下的妖刀村正。猿飞佐助将暗之军团分成三组，分别派往可能藏有村正的地方……