2006年，在面向濑户内海的四国海运城市。因腿部故障而失去成为陆上选手梦想的少女星守明桜，与挚友海添彩希一同升入高中。她结识了社团活动和新朋友，原本内心空虚的明桜正逐渐找回曾经的自己。然而，有一天彩希突然消失不见了。 在这片星空下，自古以来就存在一场延续不断的战斗。曾被神赋予天空之魂的8具巨人“星辰机（Star Mquina）”。 “乘坐它，守护从百年一遇出现的‘篡夺者’手中的生命之火，并且不要让它熄灭。” 遵循这句话，被星辰机选中的驾驶者们一路战斗至今。 岁月流转。所有星辰机都倒下后的100年。 为了延续下一个100年而建造的人工巨人“星辰机・命运尼亚・复制品”，彩希的灵魂被选为其精神燃料，明桜也因此被卷入守护所有生命的战斗之中……