2039年，地球的调查队曾在火星上遭到外星文明Tarsian的袭击而导致全灭的命运。而7年以后的2046年，地球人已经利用从Tarsian手中得来的科技建立起了强大的宇宙军，初步在近地球圈打败了Tarsian，保住了地球的安全并开始组织远征军转入反攻状态。初三女生长峰美加子和她的同学寺尾升是一对恋人，每次放学后美加子总是搭着升的单车回家，并在路上谈论他们的未来。后来，美加子作为人形战机“追猎者”的驾驶员被选拔进了由超大型母舰“吕西忒亚”号为旗舰，出发追击Tarsian。14岁的美加子踏上了宇宙行程，在火星接受了紧张而短暂的训练后便投入了对Tarsian的作战。在紧张的战斗之余，使用短信和阿升互诉情衷就成了美加子的必修课。但随着追击距离的增加，发送e-mail所需的时间也越来越长，两个人都陷入了寂寞的等待中。在激烈的奥尔特星云之战过后，地球军不顾自身的技术劣势，大范围时空转移到距离地球8.6光年的天狼星α、β星系追击Tarsian败退的残余部队。在天狼星美丽的草原上，Tarsian的主力部队出现在星球上空，将地球军死死围困，美加子抛却一切情感上的包袱投入作战。她不顾座机早已伤痕累累，冒着敌人小型战斗机疯狂的阻截，拼尽全力和对方的战舰展开近距离战斗，最终严重破坏了对方的母舰。支离破碎、失去动力的追猎者消失宇宙空间中，美加子含泪向远方的升微笑着：“升，我在这里啊。”8年后，宇宙远征军的战况传到了地球：陷入混战的其他战机战舰被全部摧毁无人生还，唯一“幸存”的吕西忒亚号也因为能源耗尽在摆脱追击时不知所踪。而这天，已经加入地球军，即将奔赴战场的阿升也收到了8年前美加子的发出的短信。他抬头仰望蓝天，回应着看不见的爱人：“美加子，我在这里啊。”