铃木园子的叔叔次郎吉不服上次失败，再次向怪盗基德下战书。这位脾气暴躁的大叔花大价钱打造了巨型飞船贝尔·雪利二世号，用镶嵌着名贵宝石“天空的贵妇人”的戒指作为赌注，邀基德前来挑战，看他能否在东京到大阪的6小时内完成这一艰巨任务。柯南、小兰等人自然也收到了邀请，连电视台的人都大张旗鼓地来了。随着时间推移，双方的对决悄然开启。与此同时，恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。不久前，红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所，盗走了一种致命病毒。 本片改编自青山刚昌的同名漫画，是该动画的第14部剧场版。