在一座宁静的小山村中，少女渡濑明日菜（金元寿子配音）常立于山顶，用父亲留下的神秘矿石（歌薇丝）当作二极管，聆听来自外面世界的动听音乐。一次放学路上，明日菜遭遇一头怪兽袭击，关键时刻，俊美少年瞬（入野自由配音）将她救下，少男少女间就此萌生出纯洁的友谊。明日菜沉浸在友谊的甜蜜里，却没料到瞬某天悄然离世。新来的男老师森崎龙司（井上和彦配音）为孩子们讲述了死国的传说，明日菜这才意识到瞬来自另一个世界雅戈泰。渡濑明日菜决定找森崎老师了解雅戈泰的传说，放学后便前往老师家中。森崎老师的妻子早逝，其真实身份是隶属某个神秘组织的士兵。森崎老师向明日菜讲述了地下世界的事情。晚上，明日菜回家途中碰到咪咪，追咪咪时遇到和瞬长得极为相像的人。然而，他们遭到一群蒙面士兵的袭击。男孩带着明日菜躲进岩洞，还是被士兵找到。士兵逼迫明日菜用歌薇丝打开雅戈泰的大门，摘掉头盔后，原来士兵就是森崎老师。男孩告知明日菜他是瞬的弟弟——心，他来到地面就是为了拿走歌薇丝，拿走明日菜脖子上的歌薇丝后便离开了。明日菜决定跟随森崎老师深入雅戈泰探寻复活的秘密，两人由此开启一段冒险之旅。他们跟着谢库纳·威玛纳前行，风餐露宿许久。与此同时，村内长老命令心赶走明日菜他们，并拿回明日菜父亲留给她的遗物歌薇丝，心剪掉头发骑马出发了。一个雨夜，森崎老师回想起自己的妻子，因打仗未能见到妻子最后一面。晚上他们睡着后，明日菜被夷人抬走。早上明日菜醒来发现身处一座废弃古堡，看到一个不会说话的孩子在哭泣，夷人也爬上来要攻击他们。这时，心突然出现救了她们。老师也在咪咪的带领下找到了昏迷的明日菜他们。两人带着受伤的心和小女孩来到一个小村子。村里的人起初不让他们进村，但因小女孩是村里一位长老的孙女，长老为表感激，允许他们在自己家里住一晚，并解释了关闭雅戈泰的原因。早上，明日菜和老师坐船离开，可这回咪咪不愿再跟他们同行。心醒来时发现咪咪已死，小女孩把咪咪交给了亚得利科。同时，心看到昨天不让他们进村的人朝着生死门追去，明白他们想杀死明日菜，便立刻骑马追去。那群人果然来到明日菜他们面前欲下杀手，心及时赶到与他们激烈战斗，明日菜他们趁机逃走。明日菜他们终于抵达菲尼斯·特拉，也就是生死门所在的悬崖边。面对陡峭的悬崖，老师毫不犹豫地爬了下去，而明日菜因害怕最终放弃了。