十六年前，电视剧《宇宙忍者》是孩子们最喜欢的节目。然而由于替身演员发生意外事故，主演者因深感内疚而辞演，这个节目就此画上了句号。 舞台转到了现在的大阪。艾尔娜、唯香、玛丽亚三个女高中生在不同的学校上学，兴趣爱好也各不相同，但她们经常在天王寺一代结伴逛街。她们总会聊些热门的奇怪话题，比如“僵尸在大阪出没”、“忍者在大阪战斗”、“恐怖分子要袭击大阪”等等。 网络上的偶像玛丽亚召开了一场个人演唱会。在京阪奈大学读书的町田被人追杀，逃进了演唱会现场。町田一直逃到了后台，但追杀他的人随即跟来，三个女高中生也被卷进了骚乱中。 町田是个数学天才，他拥有能同时引爆大量炸弹的程序。而计划袭击大阪的恐怖分子盯上了他！町田和女高中生们决定捍卫自己的城市，他们潜入了恐怖分子的基地核心。在危机时刻，空间忍者出现了！