时间来到2015年，第3新东京市正面临着使徒愈发频繁的来袭。在这片危机四伏的城市里，有三位少女在 Nico Nico 动画上上传着新歌。她们分别是石井ハルカ、谷口イズミ和松沢アヤコ。这三位市立第一中学校二年级的学生，以音乐组合“いんぱくつ。”的身份活跃于 Nico 直播平台。然而，为了应对使徒的袭击，アヤコ不得不疏散撤离，这也意味着她们决定在新歌《センチメンタルな予感》发布后解散。ハルカ、イズミ和アヤコ即将各自踏上不同的道路。此时，留下的ハルカ向イズミ提出了“某个提案”。而与此同时，第3新东京市又将迎来新一轮的使徒来袭……